Detener el deterioro, mitigar los daños y preservar la documentación conservada en los archivos y otras instituciones afines, consideradas reservas fundamentales del patrimonio documental cubano en todo tipo de soporte, motivó la creación en 2006 de la Comisión Nacional de la Memoria Histórica.
Su constitución se realizó como parte del proceso de institucionalización del país y cumpliendo indicaciones del General de Ejército Raúl Castro, con la misión de promover la conservación y difusión del Patrimonio Documental de la Nación cubana, evaluar el avance en la conservación de la memoria histórica de la nación y el perfeccionamiento de los sistemas institucionales de gestión documental y archivos de la administración pública.
En el 2017, a propuesta de Miguel Díaz-Canel Bermúdez en su condición de primer vicepresidente, se integraron a la Comisión los Sistemas Institucionales de Gestión Documental y Archivo de los Órganos y Organismos de la Administración Central del Estado. A partir de 2021 se integra al Macroprograma Ciencia, Tecnología e Innovación (CTI) como Programa Priorizado Nacional para la Memoria Histórica.
Para su control, el Programa Nacional está subdividido actualmente en cinco subprogramas de trabajo: Sistemas Institucionales de Gestión Documental y Archivos de los Órganos, Organismos y Entidades Nacionales; Sistemas Institucionales de Gestión Documental y Archivos de Organizaciones Políticas, de Masas y No Gubernamentales, desempeño de las Entidades Patrimoniales y las Comisiones de Memoria Histórica Territorial.
Los otros tres subprogramas son Conservación de fondos y colecciones en todo tipo de soporte y formato, que forman parte del Sistemas Nacional de Gestión Documental y Archivo, Informatización de los procesos de gestión documental y archivo y Preparación y fortalecimiento del capital humano.
Además cuenta con 15 Comisiones de Memoria Histórica provinciales y 168 municipales para coordinar la actividad de gestión documental en los territorios.